Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD8BP10966 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD8BP10966 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD8BP10966 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD8BP10966 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8BP10966 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8BP10966 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8BP10966 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8BP10966 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8BP10966 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD8BP10966 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8BP10966 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8BP10966 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8BP10966 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8BP10966 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8BP10966 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8BP10966 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8BP10966 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8BP10966 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8BP10966 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8BP10966 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8BP10966 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8BP10966 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8BP10966 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8BP10966 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD8BP10966 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD8BP10966 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD8BP10966 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD8BP10966 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD8BP10966 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD8BP10966 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD8BP10966 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD8BP10966 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8BP10966 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8BP10966 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8BP10966 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD8BP10966 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD8BP10966 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD8BP10966 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8BP10966 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8BP10966 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8BP10966 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8BP10966 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8BP10966 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8BP10966 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8BP10966 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8BP10966 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8BP10966 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8BP10966 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8BP10966 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8BP10966 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8BP10966 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8BP10966 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8BP10966 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8BP10966 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8BP10966 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8BP10966 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8BP10966 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8BP10966 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8BP10966 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD8BP10966 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD8BP10966 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD8BP10966 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD8BP10966 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD8BP10966 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD8BP10966 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CD8BP10966 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD8BP10966 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD8BP10966 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CD8BP10966 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CD8BP10966 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CD8BP10966 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD8BP10966 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8BP10966 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8BP10966 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8BP10966 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8BP10966 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8BP10966 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8BP10966 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8BP10966 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8BP10966 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8BP10966 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8BP10966 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD8BP10966 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD8BP10966 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8BP10966 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8BP10966 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8BP10966 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8BP10966 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8BP10966 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8BP10966 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8BP10966 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8BP10966 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8BP10966 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8BP10966 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8BP10966 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8BP10966 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8BP10966 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8BP10966 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8BP10966 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms