Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP10827 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP10827 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP10827 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP10827 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP10827 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP10827 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP10827 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP10827 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP10827 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP10827 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRAP10827 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRAP10827 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP10827 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP10827 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP10827 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP10827 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP10827 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP10827 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP10827 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP10827 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP10827 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP10827 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP10827 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP10827 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP10827 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP10827 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP10827 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP10827 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP10827 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP10827 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP10827 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP10827 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP10827 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP10827 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP10827 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP10827 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP10827 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP10827 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP10827 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP10827 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP10827 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP10827 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP10827 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP10827 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP10827 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP10827 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP10827 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THRAP10827 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
THRAP10827 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
THRAP10827 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THRAP10827 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THRAP10827 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
THRAP10827 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
THRAP10827 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
THRAP10827 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
THRAP10827 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
THRAP10827 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
THRAP10827 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
THRAP10827 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
THRAP10827 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THRAP10827 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THRAP10827 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
THRAP10827 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THRAP10827 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THRAP10827 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THRAP10827 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THRAP10827 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THRAP10827 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
THRAP10827 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THRAP10827 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THRAP10827 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THRAP10827 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THRAP10827 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THRAP10827 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THRAP10827 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THRAP10827 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THRAP10827 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP10827 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP10827 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP10827 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP10827 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP10827 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRAP10827 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP10827 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP10827 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP10827 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP10827 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRAP10827 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP10827 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP10827 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP10827 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP10827 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP10827 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRAP10827 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP10827 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP10827 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRAP10827 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP10827 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRAP10827 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms