Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF728P0DKX0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF728P0DKX0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF728P0DKX0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF728P0DKX0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF728P0DKX0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms