Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GIMD1P0DJR0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIMD1P0DJR0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GIMD1P0DJR0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIMD1P0DJR0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms