Protein–RNA interactions for Protein: P0C862

C1QTNF9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF9P0C862 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF9P0C862 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF9P0C862 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF9P0C862 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1QTNF9P0C862 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QTNF9P0C862 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF9P0C862 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms