Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M7

ACSM4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM4P0C7M7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSM4P0C7M7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSM4P0C7M7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSM4P0C7M7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM4P0C7M7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM4P0C7M7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM4P0C7M7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM4P0C7M7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM4P0C7M7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM4P0C7M7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM4P0C7M7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM4P0C7M7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACSM4P0C7M7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSM4P0C7M7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM4P0C7M7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms