Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
POLA1P09884 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
POLA1P09884 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
POLA1P09884 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
POLA1P09884 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
POLA1P09884 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
POLA1P09884 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
POLA1P09884 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
POLA1P09884 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
POLA1P09884 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
POLA1P09884 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
POLA1P09884 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
POLA1P09884 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
POLA1P09884 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
POLA1P09884 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
POLA1P09884 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
POLA1P09884 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
POLA1P09884 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
POLA1P09884 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
POLA1P09884 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
POLA1P09884 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
POLA1P09884 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
POLA1P09884 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
POLA1P09884 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
POLA1P09884 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
POLA1P09884 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
POLA1P09884 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
POLA1P09884 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
POLA1P09884 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.92■■■■■ 4.62
POLA1P09884 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
POLA1P09884 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
POLA1P09884 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
POLA1P09884 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
POLA1P09884 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
POLA1P09884 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
POLA1P09884 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
POLA1P09884 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
POLA1P09884 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
POLA1P09884 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
POLA1P09884 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
POLA1P09884 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
POLA1P09884 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
POLA1P09884 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
POLA1P09884 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.82■■■■■ 4.6
POLA1P09884 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.6
POLA1P09884 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
POLA1P09884 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
POLA1P09884 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
POLA1P09884 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
POLA1P09884 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
POLA1P09884 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
POLA1P09884 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
POLA1P09884 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
POLA1P09884 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
POLA1P09884 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
POLA1P09884 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
POLA1P09884 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
POLA1P09884 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
POLA1P09884 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
POLA1P09884 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
POLA1P09884 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
POLA1P09884 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
POLA1P09884 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
POLA1P09884 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
POLA1P09884 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
POLA1P09884 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
POLA1P09884 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
POLA1P09884 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
POLA1P09884 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC43.69■■■■■ 4.58
POLA1P09884 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
POLA1P09884 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
POLA1P09884 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
POLA1P09884 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
POLA1P09884 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
POLA1P09884 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
POLA1P09884 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
POLA1P09884 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
POLA1P09884 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
POLA1P09884 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
POLA1P09884 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
POLA1P09884 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
POLA1P09884 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
POLA1P09884 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
POLA1P09884 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
POLA1P09884 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
POLA1P09884 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC43.61■■■■■ 4.57
POLA1P09884 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
POLA1P09884 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
POLA1P09884 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
POLA1P09884 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC43.58■■■■■ 4.57
POLA1P09884 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
POLA1P09884 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
POLA1P09884 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
POLA1P09884 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
POLA1P09884 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
POLA1P09884 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
POLA1P09884 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC43.57■■■■■ 4.56
POLA1P09884 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
POLA1P09884 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
POLA1P09884 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.8 ms