Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPSAP08865 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPSAP08865 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RPSAP08865 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPSAP08865 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPSAP08865 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPSAP08865 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPSAP08865 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPSAP08865 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPSAP08865 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPSAP08865 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPSAP08865 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPSAP08865 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPSAP08865 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPSAP08865 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPSAP08865 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPSAP08865 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPSAP08865 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPSAP08865 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPSAP08865 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPSAP08865 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPSAP08865 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPSAP08865 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPSAP08865 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPSAP08865 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPSAP08865 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPSAP08865 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPSAP08865 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPSAP08865 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPSAP08865 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPSAP08865 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPSAP08865 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPSAP08865 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPSAP08865 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPSAP08865 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPSAP08865 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPSAP08865 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPSAP08865 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPSAP08865 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPSAP08865 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPSAP08865 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPSAP08865 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPSAP08865 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPSAP08865 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPSAP08865 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPSAP08865 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPSAP08865 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPSAP08865 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPSAP08865 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPSAP08865 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPSAP08865 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPSAP08865 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPSAP08865 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPSAP08865 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPSAP08865 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPSAP08865 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPSAP08865 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPSAP08865 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPSAP08865 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPSAP08865 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPSAP08865 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPSAP08865 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPSAP08865 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPSAP08865 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPSAP08865 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPSAP08865 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPSAP08865 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPSAP08865 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPSAP08865 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPSAP08865 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPSAP08865 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPSAP08865 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPSAP08865 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPSAP08865 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPSAP08865 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPSAP08865 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPSAP08865 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPSAP08865 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPSAP08865 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPSAP08865 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPSAP08865 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPSAP08865 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPSAP08865 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPSAP08865 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPSAP08865 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPSAP08865 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPSAP08865 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPSAP08865 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPSAP08865 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPSAP08865 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPSAP08865 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPSAP08865 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPSAP08865 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPSAP08865 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPSAP08865 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPSAP08865 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPSAP08865 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPSAP08865 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPSAP08865 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPSAP08865 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms