Protein–RNA interactions for Protein: P07954

FH, Fumarate hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHP07954 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHP07954 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHP07954 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHP07954 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FHP07954 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FHP07954 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FHP07954 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FHP07954 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FHP07954 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FHP07954 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FHP07954 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FHP07954 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FHP07954 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FHP07954 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FHP07954 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FHP07954 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FHP07954 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FHP07954 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FHP07954 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FHP07954 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FHP07954 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FHP07954 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FHP07954 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FHP07954 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FHP07954 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FHP07954 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FHP07954 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FHP07954 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHP07954 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHP07954 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FHP07954 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHP07954 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FHP07954 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHP07954 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHP07954 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHP07954 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHP07954 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FHP07954 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHP07954 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FHP07954 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHP07954 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FHP07954 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FHP07954 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FHP07954 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHP07954 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FHP07954 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHP07954 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHP07954 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHP07954 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHP07954 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHP07954 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FHP07954 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FHP07954 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHP07954 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHP07954 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FHP07954 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHP07954 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHP07954 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHP07954 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHP07954 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHP07954 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FHP07954 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FHP07954 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FHP07954 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FHP07954 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FHP07954 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FHP07954 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHP07954 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHP07954 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHP07954 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHP07954 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHP07954 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHP07954 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHP07954 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHP07954 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHP07954 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHP07954 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHP07954 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHP07954 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHP07954 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHP07954 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHP07954 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHP07954 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHP07954 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHP07954 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FHP07954 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms