Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAVP06756 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAVP06756 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGAVP06756 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms