Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV4-1P06312 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV4-1P06312 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV4-1P06312 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms