Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCATP04180 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCATP04180 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCATP04180 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCATP04180 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCATP04180 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCATP04180 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCATP04180 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCATP04180 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCATP04180 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCATP04180 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCATP04180 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCATP04180 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCATP04180 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCATP04180 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCATP04180 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCATP04180 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCATP04180 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCATP04180 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCATP04180 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCATP04180 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCATP04180 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCATP04180 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCATP04180 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCATP04180 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCATP04180 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCATP04180 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LCATP04180 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCATP04180 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCATP04180 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCATP04180 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCATP04180 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCATP04180 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCATP04180 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCATP04180 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCATP04180 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCATP04180 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCATP04180 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCATP04180 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCATP04180 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCATP04180 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCATP04180 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCATP04180 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCATP04180 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCATP04180 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCATP04180 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCATP04180 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCATP04180 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCATP04180 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCATP04180 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCATP04180 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCATP04180 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCATP04180 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LCATP04180 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LCATP04180 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LCATP04180 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCATP04180 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCATP04180 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCATP04180 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCATP04180 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCATP04180 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCATP04180 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCATP04180 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCATP04180 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCATP04180 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCATP04180 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCATP04180 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCATP04180 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCATP04180 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCATP04180 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCATP04180 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCATP04180 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCATP04180 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCATP04180 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCATP04180 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCATP04180 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCATP04180 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCATP04180 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCATP04180 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCATP04180 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCATP04180 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCATP04180 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCATP04180 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCATP04180 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCATP04180 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCATP04180 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCATP04180 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCATP04180 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCATP04180 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCATP04180 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCATP04180 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCATP04180 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCATP04180 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LCATP04180 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCATP04180 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LCATP04180 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCATP04180 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCATP04180 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCATP04180 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCATP04180 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms