Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HLA-DRAP01903 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HLA-DRAP01903 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DRAP01903 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HLA-DRAP01903 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DRAP01903 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms