Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
APBA3O96018 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
APBA3O96018 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
APBA3O96018 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
APBA3O96018 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
APBA3O96018 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
APBA3O96018 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
APBA3O96018 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
APBA3O96018 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
APBA3O96018 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
APBA3O96018 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
APBA3O96018 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
APBA3O96018 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
APBA3O96018 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
APBA3O96018 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
APBA3O96018 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
APBA3O96018 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
APBA3O96018 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
APBA3O96018 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
APBA3O96018 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
APBA3O96018 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
APBA3O96018 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
APBA3O96018 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.8■■■■□ 3
APBA3O96018 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
APBA3O96018 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
APBA3O96018 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
APBA3O96018 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
APBA3O96018 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
APBA3O96018 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
APBA3O96018 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
APBA3O96018 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
APBA3O96018 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
APBA3O96018 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
APBA3O96018 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
APBA3O96018 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
APBA3O96018 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
APBA3O96018 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
APBA3O96018 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
APBA3O96018 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
APBA3O96018 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
APBA3O96018 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
APBA3O96018 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
APBA3O96018 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
APBA3O96018 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
APBA3O96018 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
APBA3O96018 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
APBA3O96018 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
APBA3O96018 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
APBA3O96018 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
APBA3O96018 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
APBA3O96018 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
APBA3O96018 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
APBA3O96018 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
APBA3O96018 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
APBA3O96018 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
APBA3O96018 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
APBA3O96018 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
APBA3O96018 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
APBA3O96018 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
APBA3O96018 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
APBA3O96018 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
APBA3O96018 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
APBA3O96018 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
APBA3O96018 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
APBA3O96018 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
APBA3O96018 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
APBA3O96018 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
APBA3O96018 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
APBA3O96018 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
APBA3O96018 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
APBA3O96018 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
APBA3O96018 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
APBA3O96018 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
APBA3O96018 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
APBA3O96018 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
APBA3O96018 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
APBA3O96018 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
APBA3O96018 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
APBA3O96018 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
APBA3O96018 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
APBA3O96018 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
APBA3O96018 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
APBA3O96018 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
APBA3O96018 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
APBA3O96018 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
APBA3O96018 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
APBA3O96018 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
APBA3O96018 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
APBA3O96018 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
APBA3O96018 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
APBA3O96018 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
APBA3O96018 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
APBA3O96018 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
APBA3O96018 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
APBA3O96018 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
APBA3O96018 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
APBA3O96018 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
APBA3O96018 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
APBA3O96018 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
APBA3O96018 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms