Protein–RNA interactions for Protein: O95832

CLDN1, Claudin-1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1O95832 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN1O95832 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN1O95832 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN1O95832 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN1O95832 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN1O95832 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN1O95832 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN1O95832 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN1O95832 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN1O95832 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms