Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA4FO95754 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA4FO95754 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4FO95754 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4FO95754 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms