Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRATO95237 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRATO95237 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRATO95237 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRATO95237 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRATO95237 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRATO95237 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRATO95237 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRATO95237 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRATO95237 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRATO95237 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRATO95237 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRATO95237 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRATO95237 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRATO95237 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRATO95237 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRATO95237 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRATO95237 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRATO95237 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRATO95237 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRATO95237 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRATO95237 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRATO95237 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRATO95237 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRATO95237 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRATO95237 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRATO95237 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRATO95237 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRATO95237 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRATO95237 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRATO95237 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRATO95237 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRATO95237 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRATO95237 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRATO95237 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRATO95237 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRATO95237 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRATO95237 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRATO95237 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRATO95237 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRATO95237 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRATO95237 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRATO95237 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRATO95237 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRATO95237 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRATO95237 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRATO95237 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRATO95237 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRATO95237 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRATO95237 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRATO95237 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRATO95237 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRATO95237 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRATO95237 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRATO95237 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRATO95237 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRATO95237 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRATO95237 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRATO95237 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRATO95237 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRATO95237 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRATO95237 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRATO95237 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRATO95237 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRATO95237 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRATO95237 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRATO95237 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRATO95237 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRATO95237 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRATO95237 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRATO95237 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRATO95237 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRATO95237 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRATO95237 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRATO95237 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRATO95237 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRATO95237 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRATO95237 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRATO95237 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRATO95237 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRATO95237 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRATO95237 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRATO95237 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRATO95237 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRATO95237 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRATO95237 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRATO95237 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRATO95237 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRATO95237 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRATO95237 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRATO95237 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRATO95237 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRATO95237 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRATO95237 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRATO95237 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRATO95237 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRATO95237 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRATO95237 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRATO95237 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRATO95237 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms