Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPO95166 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABARAPO95166 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPO95166 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms