Protein–RNA interactions for Protein: O75943

RAD17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD17O75943 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RAD17O75943 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RAD17O75943 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RAD17O75943 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAD17O75943 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAD17O75943 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAD17O75943 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RAD17O75943 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
RAD17O75943 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RAD17O75943 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RAD17O75943 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
RAD17O75943 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RAD17O75943 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RAD17O75943 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
RAD17O75943 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RAD17O75943 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RAD17O75943 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RAD17O75943 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RAD17O75943 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD17O75943 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD17O75943 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD17O75943 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD17O75943 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD17O75943 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RAD17O75943 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
RAD17O75943 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAD17O75943 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAD17O75943 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAD17O75943 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAD17O75943 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RAD17O75943 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RAD17O75943 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RAD17O75943 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAD17O75943 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAD17O75943 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RAD17O75943 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
RAD17O75943 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAD17O75943 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAD17O75943 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAD17O75943 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAD17O75943 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAD17O75943 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAD17O75943 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
RAD17O75943 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAD17O75943 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD17O75943 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD17O75943 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD17O75943 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD17O75943 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD17O75943 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD17O75943 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RAD17O75943 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RAD17O75943 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RAD17O75943 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RAD17O75943 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAD17O75943 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD17O75943 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RAD17O75943 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RAD17O75943 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RAD17O75943 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RAD17O75943 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
RAD17O75943 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
RAD17O75943 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RAD17O75943 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RAD17O75943 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RAD17O75943 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RAD17O75943 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RAD17O75943 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RAD17O75943 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RAD17O75943 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RAD17O75943 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RAD17O75943 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RAD17O75943 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RAD17O75943 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RAD17O75943 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD17O75943 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD17O75943 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD17O75943 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
RAD17O75943 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
RAD17O75943 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD17O75943 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD17O75943 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD17O75943 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD17O75943 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD17O75943 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD17O75943 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD17O75943 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD17O75943 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD17O75943 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD17O75943 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD17O75943 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD17O75943 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD17O75943 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD17O75943 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD17O75943 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD17O75943 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD17O75943 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAD17O75943 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
RAD17O75943 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAD17O75943 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms