Protein–RNA interactions for Protein: O75783

RHBDL1, Rhomboid-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1O75783 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDL1O75783 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.3 ms