Protein–RNA interactions for Protein: O75631

UPK3A, Uroplakin-3a, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3AO75631 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK3AO75631 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK3AO75631 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3AO75631 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3AO75631 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK3AO75631 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3AO75631 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3AO75631 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK3AO75631 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK3AO75631 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK3AO75631 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK3AO75631 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK3AO75631 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK3AO75631 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK3AO75631 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK3AO75631 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms