Protein–RNA interactions for Protein: O75592

MYCBP2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, humanhuman

Predictions only

Length 4,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBP2O75592 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MYCBP2O75592 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MYCBP2O75592 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms