Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSVO60911 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSVO60911 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSVO60911 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSVO60911 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSVO60911 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSVO60911 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSVO60911 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSVO60911 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSVO60911 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSVO60911 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSVO60911 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSVO60911 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSVO60911 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSVO60911 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSVO60911 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSVO60911 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSVO60911 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSVO60911 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSVO60911 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSVO60911 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSVO60911 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSVO60911 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSVO60911 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSVO60911 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSVO60911 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSVO60911 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSVO60911 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSVO60911 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSVO60911 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSVO60911 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSVO60911 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSVO60911 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSVO60911 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSVO60911 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSVO60911 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSVO60911 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSVO60911 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSVO60911 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSVO60911 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSVO60911 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSVO60911 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSVO60911 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSVO60911 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSVO60911 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSVO60911 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSVO60911 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSVO60911 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSVO60911 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSVO60911 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSVO60911 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSVO60911 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSVO60911 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSVO60911 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSVO60911 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSVO60911 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSVO60911 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSVO60911 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSVO60911 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSVO60911 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSVO60911 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSVO60911 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSVO60911 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSVO60911 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSVO60911 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSVO60911 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSVO60911 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSVO60911 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSVO60911 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSVO60911 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSVO60911 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSVO60911 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSVO60911 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSVO60911 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSVO60911 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSVO60911 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSVO60911 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSVO60911 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSVO60911 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSVO60911 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSVO60911 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSVO60911 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSVO60911 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSVO60911 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSVO60911 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSVO60911 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSVO60911 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSVO60911 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSVO60911 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSVO60911 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSVO60911 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTSVO60911 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTSVO60911 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSVO60911 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSVO60911 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSVO60911 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSVO60911 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSVO60911 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSVO60911 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSVO60911 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms