Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNG3O60359 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNG3O60359 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNG3O60359 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNG3O60359 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNG3O60359 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNG3O60359 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNG3O60359 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNG3O60359 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNG3O60359 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNG3O60359 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNG3O60359 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNG3O60359 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNG3O60359 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNG3O60359 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNG3O60359 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNG3O60359 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms