Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAK2O60296 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAK2O60296 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK2O60296 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK2O60296 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms