Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCXO43602 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCXO43602 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCXO43602 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCXO43602 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCXO43602 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCXO43602 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCXO43602 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCXO43602 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCXO43602 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCXO43602 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCXO43602 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCXO43602 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCXO43602 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCXO43602 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCXO43602 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCXO43602 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCXO43602 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCXO43602 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCXO43602 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCXO43602 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCXO43602 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCXO43602 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCXO43602 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCXO43602 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCXO43602 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCXO43602 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCXO43602 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCXO43602 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DCXO43602 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCXO43602 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCXO43602 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DCXO43602 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCXO43602 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCXO43602 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCXO43602 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCXO43602 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCXO43602 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DCXO43602 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCXO43602 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCXO43602 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCXO43602 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCXO43602 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCXO43602 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCXO43602 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCXO43602 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCXO43602 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCXO43602 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DCXO43602 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCXO43602 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DCXO43602 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DCXO43602 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCXO43602 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCXO43602 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCXO43602 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCXO43602 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCXO43602 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCXO43602 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCXO43602 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCXO43602 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCXO43602 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCXO43602 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCXO43602 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCXO43602 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCXO43602 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCXO43602 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DCXO43602 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCXO43602 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DCXO43602 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCXO43602 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCXO43602 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCXO43602 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCXO43602 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DCXO43602 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCXO43602 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCXO43602 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DCXO43602 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCXO43602 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCXO43602 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCXO43602 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCXO43602 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCXO43602 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCXO43602 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCXO43602 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DCXO43602 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DCXO43602 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DCXO43602 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DCXO43602 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DCXO43602 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DCXO43602 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCXO43602 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCXO43602 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCXO43602 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCXO43602 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCXO43602 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCXO43602 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCXO43602 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DCXO43602 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCXO43602 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCXO43602 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms