Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RASA4O43374 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RASA4O43374 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RASA4O43374 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RASA4O43374 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RASA4O43374 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RASA4O43374 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASA4O43374 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASA4O43374 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RASA4O43374 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASA4O43374 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASA4O43374 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RASA4O43374 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RASA4O43374 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASA4O43374 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASA4O43374 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASA4O43374 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASA4O43374 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASA4O43374 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASA4O43374 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASA4O43374 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASA4O43374 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASA4O43374 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASA4O43374 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASA4O43374 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASA4O43374 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASA4O43374 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASA4O43374 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASA4O43374 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASA4O43374 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASA4O43374 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RASA4O43374 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RASA4O43374 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RASA4O43374 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RASA4O43374 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASA4O43374 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASA4O43374 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASA4O43374 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASA4O43374 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASA4O43374 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASA4O43374 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASA4O43374 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASA4O43374 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASA4O43374 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RASA4O43374 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RASA4O43374 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RASA4O43374 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RASA4O43374 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RASA4O43374 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASA4O43374 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASA4O43374 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASA4O43374 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASA4O43374 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASA4O43374 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASA4O43374 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASA4O43374 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASA4O43374 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RASA4O43374 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RASA4O43374 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASA4O43374 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RASA4O43374 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASA4O43374 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASA4O43374 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASA4O43374 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RASA4O43374 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RASA4O43374 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASA4O43374 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASA4O43374 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASA4O43374 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASA4O43374 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASA4O43374 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASA4O43374 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASA4O43374 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASA4O43374 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASA4O43374 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASA4O43374 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms