Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SART1O43290 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SART1O43290 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SART1O43290 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SART1O43290 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SART1O43290 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SART1O43290 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SART1O43290 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SART1O43290 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SART1O43290 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SART1O43290 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SART1O43290 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SART1O43290 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SART1O43290 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SART1O43290 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SART1O43290 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SART1O43290 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SART1O43290 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SART1O43290 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SART1O43290 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SART1O43290 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SART1O43290 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SART1O43290 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SART1O43290 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SART1O43290 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SART1O43290 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SART1O43290 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SART1O43290 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SART1O43290 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SART1O43290 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SART1O43290 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SART1O43290 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SART1O43290 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SART1O43290 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SART1O43290 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SART1O43290 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SART1O43290 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SART1O43290 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SART1O43290 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SART1O43290 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SART1O43290 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SART1O43290 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SART1O43290 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SART1O43290 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SART1O43290 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SART1O43290 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SART1O43290 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SART1O43290 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SART1O43290 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SART1O43290 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SART1O43290 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SART1O43290 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SART1O43290 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SART1O43290 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SART1O43290 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SART1O43290 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SART1O43290 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SART1O43290 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SART1O43290 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SART1O43290 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SART1O43290 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SART1O43290 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SART1O43290 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SART1O43290 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SART1O43290 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SART1O43290 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SART1O43290 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SART1O43290 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SART1O43290 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SART1O43290 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SART1O43290 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SART1O43290 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SART1O43290 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SART1O43290 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SART1O43290 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SART1O43290 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SART1O43290 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SART1O43290 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SART1O43290 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SART1O43290 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SART1O43290 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SART1O43290 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SART1O43290 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SART1O43290 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SART1O43290 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SART1O43290 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SART1O43290 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SART1O43290 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SART1O43290 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SART1O43290 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SART1O43290 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SART1O43290 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SART1O43290 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SART1O43290 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SART1O43290 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SART1O43290 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SART1O43290 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SART1O43290 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SART1O43290 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SART1O43290 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms