Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIAH2O43255 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIAH2O43255 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIAH2O43255 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIAH2O43255 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIAH2O43255 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms