Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 416.39■□□□□ 0.213e-25■■■■■ 51.6
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RBFOX2O43251 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 313.42□□□□□ -0.269e-10■■■■■ 51.6
RBFOX2O43251 TFG-205ENST00000479672 776 ntTSL 318.05■□□□□ 0.482e-11■■■■■ 51.2
RBFOX2O43251 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-11■■■■■ 51.2
RBFOX2O43251 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-11■■■■■ 51.2
RBFOX2O43251 TFG-203ENST00000463568 723 ntTSL 313.74□□□□□ -0.212e-11■■■■■ 51.2
RBFOX2O43251 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-11■■■■■ 51.2
RBFOX2O43251 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.822e-11■■■■■ 51.2
RBFOX2O43251 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.462e-11■■■■■ 51.2
RBFOX2O43251 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.396e-12■■■■■ 51.2
RBFOX2O43251 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.246e-12■■■■■ 51.2
RBFOX2O43251 FBXL19-203ENST00000427128 3312 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.316e-12■■■■■ 51.2
RBFOX2O43251 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.46e-12■■■■■ 51.2
RBFOX2O43251 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.675e-10■■■■■ 51
RBFOX2O43251 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.695e-10■■■■■ 51
RBFOX2O43251 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.925e-10■■■■■ 51
RBFOX2O43251 SH3PXD2A-201ENST00000315994 5504 ntTSL 1 (best)10.71□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 50.7
RBFOX2O43251 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.589e-10■■■■■ 50.6
RBFOX2O43251 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.529e-10■■■■■ 50.6
RBFOX2O43251 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.499e-10■■■■■ 50.6
RBFOX2O43251 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.499e-10■■■■■ 50.6
RBFOX2O43251 SREBF1-223ENST00000584760 564 ntTSL 210.25□□□□□ -0.771e-8■■■■■ 50.5
RBFOX2O43251 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.698e-8■■■■■ 50.5
RBFOX2O43251 KIF13A-210ENST00000506044 810 ntTSL 49.65□□□□□ -0.868e-8■■■■■ 50.5
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RBFOX2O43251 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.18e-8■■■■■ 50.5
RBFOX2O43251 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.148e-8■■■■■ 50.5
RBFOX2O43251 KIF13A-202ENST00000358380 4200 ntTSL 1 (best)6.42□□□□□ -1.388e-8■■■■■ 50.5
RBFOX2O43251 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.398e-8■■■■■ 50.5
RBFOX2O43251 KIF13A-206ENST00000502297 4009 ntTSL 56.28□□□□□ -1.48e-8■■■■■ 50.5
RBFOX2O43251 KIF13A-212ENST00000514714 602 ntTSL 41.99□□□□□ -2.098e-8■■■■■ 50.5
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RBFOX2O43251 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 50.3
RBFOX2O43251 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 50.3
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RBFOX2O43251 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.222e-14■■■■■ 49.8
RBFOX2O43251 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.572e-14■■■■■ 49.8
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RBFOX2O43251 SKP1-204ENST00000517691 2033 ntTSL 1 (best)2.11□□□□□ -2.072e-14■■■■■ 49.8
RBFOX2O43251 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.132e-14■■■■■ 49.8
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RBFOX2O43251 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 513.95□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 49.7
RBFOX2O43251 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 213.63□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 49.7
RBFOX2O43251 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 413.5□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 49.7
RBFOX2O43251 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.88□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 49.7
RBFOX2O43251 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 411.93□□□□□ -0.52e-9■■■■■ 49.7
RBFOX2O43251 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.66□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 49.7
RBFOX2O43251 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 211.41□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 49.7
RBFOX2O43251 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.98□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 49.7
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RBFOX2O43251 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 49.7
RBFOX2O43251 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 49.7
RBFOX2O43251 CCDC88B-204ENST00000463837 5235 ntTSL 215.98■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 49.7
RBFOX2O43251 CCDC88B-209ENST00000494080 4563 ntTSL 213.51□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 49.7
RBFOX2O43251 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 49.5
RBFOX2O43251 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 49.5
RBFOX2O43251 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 49.5
RBFOX2O43251 TMEM120B-201ENST00000342607 2766 ntTSL 218.94■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 49.3
RBFOX2O43251 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 49.3
RBFOX2O43251 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 49.3
RBFOX2O43251 TMEM120B-207ENST00000541467 2959 ntTSL 59.72□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 49.3
RBFOX2O43251 DOCK6-203ENST00000585904 554 ntTSL 411.87□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 49.3
RBFOX2O43251 DOCK6-212ENST00000590680 1391 ntTSL 511.12□□□□□ -0.633e-7■■■■■ 49.3
RBFOX2O43251 STX1A-211ENST00000491645 650 ntTSL 214.39□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 49.2
RBFOX2O43251 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 415.23■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 49.2
RBFOX2O43251 KIAA0895L-207ENST00000563918 798 ntTSL 213.52□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 49.1
RBFOX2O43251 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.469e-10■■■■■ 49.1
RBFOX2O43251 WDR90-208ENST00000547543 1060 ntTSL 514.74□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 48.9
RBFOX2O43251 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 516.6■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 48.7
RBFOX2O43251 GAK-209ENST00000507580 468 ntTSL 416.04■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 48.7
RBFOX2O43251 RANBP3-209ENST00000587411 2669 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.21e-13■■■■■ 48.6
RBFOX2O43251 RANBP3-206ENST00000586344 2554 ntTSL 211.07□□□□□ -0.641e-13■■■■■ 48.6
RBFOX2O43251 SPATA20-218ENST00000511605 559 ntTSL 414.39□□□□□ -0.112e-10■■■■■ 48.4
RBFOX2O43251 SORBS1-220ENST00000634504 1847 ntTSL 211.8□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 48.4
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