Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFS4O43181 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFS4O43181 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFS4O43181 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFS4O43181 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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