Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUPL2O15504 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUPL2O15504 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUPL2O15504 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUPL2O15504 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1777.3 ms