Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1CO15160 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1CO15160 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1CO15160 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR1CO15160 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1CO15160 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms