Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MUSKO15146 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MUSKO15146 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MUSKO15146 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MUSKO15146 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MUSKO15146 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MUSKO15146 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MUSKO15146 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MUSKO15146 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MUSKO15146 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MUSKO15146 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MUSKO15146 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MUSKO15146 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MUSKO15146 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MUSKO15146 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MUSKO15146 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MUSKO15146 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MUSKO15146 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MUSKO15146 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MUSKO15146 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MUSKO15146 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MUSKO15146 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MUSKO15146 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MUSKO15146 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MUSKO15146 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MUSKO15146 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MUSKO15146 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MUSKO15146 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MUSKO15146 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MUSKO15146 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MUSKO15146 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MUSKO15146 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MUSKO15146 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MUSKO15146 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MUSKO15146 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MUSKO15146 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MUSKO15146 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MUSKO15146 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MUSKO15146 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MUSKO15146 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MUSKO15146 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MUSKO15146 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MUSKO15146 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MUSKO15146 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MUSKO15146 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MUSKO15146 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MUSKO15146 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MUSKO15146 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MUSKO15146 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MUSKO15146 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MUSKO15146 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MUSKO15146 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MUSKO15146 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MUSKO15146 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MUSKO15146 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MUSKO15146 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MUSKO15146 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MUSKO15146 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MUSKO15146 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MUSKO15146 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MUSKO15146 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MUSKO15146 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MUSKO15146 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MUSKO15146 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MUSKO15146 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MUSKO15146 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MUSKO15146 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MUSKO15146 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MUSKO15146 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MUSKO15146 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MUSKO15146 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MUSKO15146 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MUSKO15146 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUSKO15146 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUSKO15146 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUSKO15146 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUSKO15146 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MUSKO15146 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MUSKO15146 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MUSKO15146 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MUSKO15146 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MUSKO15146 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MUSKO15146 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MUSKO15146 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MUSKO15146 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MUSKO15146 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MUSKO15146 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MUSKO15146 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MUSKO15146 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MUSKO15146 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MUSKO15146 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUSKO15146 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUSKO15146 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MUSKO15146 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MUSKO15146 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MUSKO15146 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MUSKO15146 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MUSKO15146 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MUSKO15146 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MUSKO15146 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms