Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2A1O14983 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2A1O14983 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2A1O14983 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2A1O14983 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP2A1O14983 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP2A1O14983 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2A1O14983 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2A1O14983 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2A1O14983 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms