Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FFAR3O14843 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FFAR3O14843 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FFAR3O14843 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FFAR3O14843 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms