Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP9YO00507 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP9YO00507 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP9YO00507 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP9YO00507 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP9YO00507 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP9YO00507 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP9YO00507 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP9YO00507 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP9YO00507 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP9YO00507 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP9YO00507 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP9YO00507 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP9YO00507 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP9YO00507 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP9YO00507 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP9YO00507 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP9YO00507 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP9YO00507 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP9YO00507 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP9YO00507 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP9YO00507 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP9YO00507 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP9YO00507 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP9YO00507 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP9YO00507 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP9YO00507 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP9YO00507 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP9YO00507 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP9YO00507 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP9YO00507 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP9YO00507 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP9YO00507 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP9YO00507 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP9YO00507 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP9YO00507 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP9YO00507 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP9YO00507 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP9YO00507 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP9YO00507 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP9YO00507 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP9YO00507 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP9YO00507 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP9YO00507 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP9YO00507 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP9YO00507 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP9YO00507 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP9YO00507 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP9YO00507 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP9YO00507 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP9YO00507 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP9YO00507 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9YO00507 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9YO00507 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9YO00507 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9YO00507 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9YO00507 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9YO00507 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9YO00507 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9YO00507 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9YO00507 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9YO00507 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP9YO00507 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP9YO00507 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP9YO00507 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP9YO00507 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP9YO00507 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP9YO00507 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP9YO00507 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP9YO00507 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP9YO00507 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP9YO00507 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP9YO00507 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP9YO00507 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP9YO00507 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP9YO00507 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP9YO00507 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP9YO00507 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP9YO00507 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP9YO00507 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP9YO00507 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP9YO00507 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP9YO00507 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP9YO00507 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9YO00507 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9YO00507 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9YO00507 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9YO00507 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9YO00507 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP9YO00507 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP9YO00507 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP9YO00507 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP9YO00507 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP9YO00507 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9YO00507 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9YO00507 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9YO00507 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9YO00507 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP9YO00507 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP9YO00507 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms