Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF10AO00220 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF10AO00220 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFRSF10AO00220 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFRSF10AO00220 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFRSF10AO00220 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF10AO00220 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms