Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYO1FO00160 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1FO00160 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYO1FO00160 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYO1FO00160 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYO1FO00160 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms