Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVH48-1M5A8F1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVH48-1M5A8F1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVH48-1M5A8F1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVH48-1M5A8F1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVH48-1M5A8F1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVH48-1M5A8F1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVH48-1M5A8F1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVH48-1M5A8F1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVH48-1M5A8F1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVH48-1M5A8F1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVH48-1M5A8F1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVH48-1M5A8F1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVH48-1M5A8F1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVH48-1M5A8F1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVH48-1M5A8F1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVH48-1M5A8F1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVH48-1M5A8F1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVH48-1M5A8F1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVH48-1M5A8F1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVH48-1M5A8F1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVH48-1M5A8F1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVH48-1M5A8F1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVH48-1M5A8F1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVH48-1M5A8F1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms