Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMO7DNF2Z398 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMO7DNF2Z398 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMO7DNF2Z398 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO7DNF2Z398 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMO7DNF2Z398 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMO7DNF2Z398 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7DNF2Z398 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7DNF2Z398 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7DNF2Z398 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMO7DNF2Z398 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7DNF2Z398 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7DNF2Z398 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7DNF2Z398 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7DNF2Z398 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7DNF2Z398 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMO7DNF2Z398 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.6 ms