Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
E9PCH4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
E9PCH4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
E9PCH4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
E9PCH4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
E9PCH4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
E9PCH4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
E9PCH4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
E9PCH4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
E9PCH4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
E9PCH4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
E9PCH4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
E9PCH4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
E9PCH4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
E9PCH4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
E9PCH4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
E9PCH4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
E9PCH4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
E9PCH4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
E9PCH4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
E9PCH4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
E9PCH4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
E9PCH4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
E9PCH4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
E9PCH4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
E9PCH4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
E9PCH4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
E9PCH4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
E9PCH4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
E9PCH4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
E9PCH4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
E9PCH4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
E9PCH4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
E9PCH4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
E9PCH4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
E9PCH4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
E9PCH4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
E9PCH4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
E9PCH4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
E9PCH4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
E9PCH4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
E9PCH4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
E9PCH4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
E9PCH4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
E9PCH4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
E9PCH4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
E9PCH4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
E9PCH4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
E9PCH4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
E9PCH4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
E9PCH4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
E9PCH4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
E9PCH4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
E9PCH4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
E9PCH4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
E9PCH4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
E9PCH4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
E9PCH4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
E9PCH4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
E9PCH4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
E9PCH4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
E9PCH4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
E9PCH4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
E9PCH4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
E9PCH4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
E9PCH4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
E9PCH4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
E9PCH4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
E9PCH4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
E9PCH4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
E9PCH4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
E9PCH4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
E9PCH4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
E9PCH4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
E9PCH4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
E9PCH4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
E9PCH4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
E9PCH4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
E9PCH4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
E9PCH4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
E9PCH4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
E9PCH4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
E9PCH4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
E9PCH4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
E9PCH4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
E9PCH4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
E9PCH4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
E9PCH4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
E9PCH4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
E9PCH4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
E9PCH4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
E9PCH4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
E9PCH4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
E9PCH4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
E9PCH4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
E9PCH4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
E9PCH4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
E9PCH4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
E9PCH4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
E9PCH4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms