Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E9PBE3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E9PBE3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E9PBE3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
E9PBE3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PBE3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PBE3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PBE3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PBE3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PBE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PBE3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PBE3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PBE3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PBE3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PBE3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PBE3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PBE3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E9PBE3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E9PBE3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
E9PBE3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E9PBE3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PBE3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PBE3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PBE3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PBE3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PBE3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PBE3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PBE3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PBE3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PBE3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PBE3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PBE3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PBE3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PBE3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PBE3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PBE3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PBE3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PBE3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PBE3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PBE3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PBE3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PBE3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PBE3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PBE3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PBE3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PBE3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PBE3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PBE3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PBE3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PBE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PBE3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PBE3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E9PBE3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E9PBE3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E9PBE3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E9PBE3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E9PBE3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E9PBE3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E9PBE3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E9PBE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E9PBE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E9PBE3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
E9PBE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E9PBE3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E9PBE3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E9PBE3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
E9PBE3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E9PBE3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
E9PBE3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E9PBE3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E9PBE3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PBE3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PBE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PBE3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PBE3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PBE3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PBE3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PBE3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PBE3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PBE3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PBE3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PBE3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PBE3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PBE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PBE3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PBE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PBE3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PBE3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PBE3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PBE3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PBE3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PBE3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PBE3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PBE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PBE3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PBE3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PBE3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PBE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PBE3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PBE3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms