Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPBD1B2RD01 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPBD1B2RD01 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPBD1B2RD01 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPBD1B2RD01 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms