Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRIQ3A6PVS8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRIQ3A6PVS8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms