Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A6NL46 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A6NL46 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A6NL46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NL46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NL46 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NL46 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NL46 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NL46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NL46 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NL46 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NL46 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A6NL46 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A6NL46 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A6NL46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A6NL46 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A6NL46 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NL46 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NL46 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NL46 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NL46 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NL46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NL46 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NL46 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NL46 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NL46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NL46 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NL46 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NL46 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A6NL46 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A6NL46 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NL46 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NL46 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NL46 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NL46 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NL46 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NL46 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NL46 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NL46 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NL46 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NL46 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NL46 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NL46 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NL46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NL46 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NL46 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NL46 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24■■□□□ 1.43
A6NL46 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
A6NL46 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NL46 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NL46 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NL46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NL46 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NL46 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NL46 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NL46 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NL46 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NL46 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NL46 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NL46 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NL46 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NL46 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NL46 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NL46 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NL46 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NL46 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NL46 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NL46 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NL46 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NL46 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NL46 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NL46 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NL46 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NL46 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NL46 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A6NL46 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NL46 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NL46 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NL46 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NL46 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A6NL46 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A6NL46 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A6NL46 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A6NL46 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A6NL46 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A6NL46 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A6NL46 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NL46 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NL46 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms