Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35F4A4IF30 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC35F4A4IF30 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35F4A4IF30 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.2 ms