Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4D1N5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4D1N5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4D1N5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4D1N5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A4D1N5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4D1N5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4D1N5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A4D1N5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4D1N5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4D1N5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4D1N5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4D1N5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4D1N5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A4D1N5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4D1N5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A4D1N5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4D1N5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A4D1N5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4D1N5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4D1N5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4D1N5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4D1N5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A4D1N5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A4D1N5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A4D1N5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4D1N5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4D1N5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4D1N5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A4D1N5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4D1N5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4D1N5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4D1N5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A4D1N5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
A4D1N5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4D1N5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4D1N5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4D1N5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4D1N5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4D1N5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A4D1N5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4D1N5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4D1N5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4D1N5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4D1N5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4D1N5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4D1N5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A4D1N5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4D1N5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4D1N5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4D1N5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4D1N5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4D1N5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4D1N5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A4D1N5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4D1N5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4D1N5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A4D1N5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4D1N5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4D1N5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4D1N5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4D1N5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A4D1N5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4D1N5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4D1N5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4D1N5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4D1N5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4D1N5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4D1N5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4D1N5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4D1N5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4D1N5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4D1N5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4D1N5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4D1N5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4D1N5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4D1N5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4D1N5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4D1N5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4D1N5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4D1N5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4D1N5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4D1N5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4D1N5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4D1N5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4D1N5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4D1N5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4D1N5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A4D1N5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4D1N5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4D1N5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4D1N5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A4D1N5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4D1N5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4D1N5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4D1N5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4D1N5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4D1N5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A4D1N5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4D1N5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms