Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM30-201ENST00000369400 2963 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLAMF7-201ENST00000359331 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FOSB-210ENST00000591858 3658 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKG2-202ENST00000395578 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A2-206ENST00000567238 3160 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD9-201ENST00000258436 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RANGAP1-202ENST00000405486 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TUB-202ENST00000305253 6420 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IKBKB-230ENST00000629753 4069 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPAN18-201ENST00000340160 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D16-202ENST00000340848 4244 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR50-201ENST00000218316 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD19-201ENST00000304372 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP12-4-201ENST00000391618 447 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00689-201ENST00000413238 4684 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355298.1-201ENST00000425391 180 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ORM2-201ENST00000431067 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4F26P-202ENST00000433357 852 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DDTP1-201ENST00000443589 383 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL6P1-201ENST00000449877 453 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB15-205ENST00000451215 2956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms