Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ANK3Q12955 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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